Midt i byen ligger det imponerende tidligere klosteret Allerheiligen. Benediktinere, paulinere og korherrer bodde her før stiften ble overført til verdslige formål under reformasjonen. Klosterkirken, som er det største romantiske kirkebygget i Sveits, ble evangelisk kirke, og resten av anlegget huser i dag Museum zu Allerheiligen og er tradisjonen tro og er et sted for viten og kultur og en møteplass.
En fast utstilling med temaene regional arkeologi, tidlige høykulturer, kulturhistorie om Schaffhausen, sveitsisk kunst, regional naturhistorie og fugler, gjør dette til det største universalmuseet i Sveits. Vekslende særutstillinger setter prikken over i'en på det engasjerte museumskonseptet.